1.取小黄豆200克，取出异物、虫咬、霉变等杂质。用清水洗净，去除附着在其表面的浮灰。清洗干净后用纯净水浸泡8小时。（黄豆最好是纳豆专用黄豆，直径比较小的那种黄豆。）

2.将泡好的黄豆，放入蒸锅中，隔水蒸90分钟。

3.制作纳豆很容易感染杂菌，制作用具前务必开水冲烫，开水装入发酵桶10-15分钟。（必要时用热碱水或白醋清洗，再用开水清洗干净。）

4.将蒸好的黄豆冷却至40度左右，不烫手为宜。

5.取一条纳豆菌粉。

6.均匀撒在黄豆中，加入白糖并搅拌均匀。

7.将接种好的黄豆置于纳豆机中发酵16 — 20小时，纳豆为喜氧发酵，不要盖最上面的一层密封盖。

8.夏季时间会短一些，冬季的话还要延长6小时左右。

9.发酵结束后，豆子上会均匀覆盖一层白膜，搅拌后有强韧拉丝。（一定要将做好的纳豆先放入冰箱内冷藏，使其低温熟成8小时左右以后再食用。）